研究报告

兴安落叶松Ty3-gypsy型逆转座子逆转录酶的多样性分析  

张文波1 , 陈凌2 , 李雪辉1, 3 , 白玉娥1 , 林晓飞2
1内蒙古农业大学, 呼和浩特, 010019;
2内蒙古大学,呼和浩特, 010021;
3呼伦贝尔市林木种苗站, 呼伦贝尔, 021000
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2016 年, 第 14卷, 第 6 篇   doi: 10.5376/..00.
收稿日期: 2015年11月18日    接受日期: 2015年12月30日    发表日期: 2016年01月20日
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摘 要

为分析兴安落叶松(Larix gmelinii Rupr.)逆转座子的特点及其多样性与系统进化关系,本研究利用兼并-PCR技术克隆了27条Ty3-gypsy型逆转座子逆转录酶基因序列。这些核苷酸序列长度变化范围为376 ~ 417 bp,同源性范围为55.9% ~ 91.4%,具有较高的异质性。系统聚类分析发现,这27条核苷酸序列被分为7个组。翻译成氨基酸后,其中有8条序列出现了终止密码子突变,有2条序列出现了移框突变。将其氨基酸序列与已登录的其它物种的Ty3-gypsy型逆转座子逆转录酶进行聚类分析发现,兴安落叶松的Ty3-gypsy型逆转座子与枣、黄瓜、可可树等同类型的逆转座子逆转录酶有较近的亲缘关系。以上研究表明兴安落叶松的逆转座子具有高度的多样性,可为分析兴安落叶松基因组构成及遗传多样性提供实验依据。

关键词
兴安落叶松; Ty3-gypsy型逆转座子; 逆转录酶; 异质性
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《分子植物育种》印刷版
• 第 14 卷
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